Biomarker Kutatócsoport

Vezetője: 
Dr. habil. Csősz Éva, PhD, DSc
Tagjai: 

 

Prof. Dr. Tőzsér József – egyetemi tanár, intézetvezető

Dr. Kalló Gergő – tudományos munkatárs

Dr. Emri Miklós tudományos főmunkatárs

Prof. Dr. Csutak Adrienne egyetemi tanár, klinikavezető szemész főorvos

Kovács Renáta – tanaszéki mérnök - gyereknevelési szabadságon

Bereczki Kamilla – laboratóriumi analitikus - gyereknevelési szabadságon

Kökényesiné Csáki Julianna - laboratóriumi asszisztens

Ph.D. hallgatók

Ajneesh Kumar - PhD hallgató

Erdenetsetseg Nokhoijav - PhD hallgató

Guba Andrea - PhD hallgató

Mabuse Moagi - PhD hallgató

TDK hallgatók

Vo Minh Doan - orvostanhallgató

Bertalan Petra - klinikai kutató MSc

Szász Viktória - biotechnológus MSc

 

Célkitűzés

A Biomarker kutatócsoport elsődleges célja olyan molekulák azonosítása, amelyek elősegíthetik betegségek diagnózisát, illetve terápiás célpontokként szolgálhatnak. A kutatócsoport elsősorban az idősödő populációt érintő betegségek, mint a cukorbetegség, és Alzheimer kór, valamint a kardiovaszkuláris megbetegedések és bizonyos daganatok molekuláris mechanizmusának tanulmányozását illetve a diagnózist elősegítő biomarkerek azonosítását tűzte ki célul. A tagok elkötelezettek olyan tömegspektrometriás módszerfejlesztések irányába, amelyek segítségével, nagyfokú szelektivitás és érzékenység mellett, célzott módon lehet vizsgálni a fehérjék és kis molekulák mennyiségi változásait a biológiai mintákban.

Kutatási témák

Alzheimer kórra jellemző könny biomarkerek azonosítása

 

Az Alzheimer kór a leggyakrabban előforduló neurodegeneratív betegség, mely több millió embert érint a világon. Kialakulásában fő szerepet játszanak az aggregálódott amiloid-β peptidek, valamint az intracelluláris neurofibrillum kötegek, melyek a neurális működési zavarokat és nagymértékű sejtpusztulást okoznak. Több kutatócsoport is azonosított amiloid plakkokat Alzheimer kóros betegek szemében, így a betegség patomechanizmusa valószínűleg a szemet is érinti. A könny egy egyszerű módon gyűjthető, fehérjében, lipidekben és egyéb szerves molekulákban gazdag testfolyadék, mely az immunrendszer kémiai barrierjének részét képezi. Előzetes kutatások több mint 1500 különböző fehérjét azonosítottak a könnyfilm rétegben, melyek nagy részét a különféle antimikrobiális és immunmodulátor fehérjék teszik ki. Kutatásunk során Alzheimer kóros betegek könny mintáit vizsgáljuk klasszikus proteomikai és célzott tömegspektrometriás módszerek segítségével új potenciális biomarkerek azonosítása érdekében.

 

A verejték proteomikai vizsgálata

 

A verejték a szervezet elsődleges védelmi vonalában kémiai barrierként funkcionál magas antimikrobiális és immunmodulátor fehérje tartalma miatt. Ezen antimikrobiális peptidek egy része konstitutívan expresszálódik, míg mások expressziója patogén általi stimulus hatására indukálódik. Korszerű tömegspektrometriás kvantitálási technikák alkalmazásával munkacsoportunk sikeresen azonosította a verejtéket alkotó fő fehérjéket, melyek mindegyike a veleszületett immunrendszer tagjaként funkcionál. Ezen vizsgálataink későbbi verejték biomarker kutatások kiindulópontként szolgálhatnak.

 

 

Szájüregi laphámkarcinómára jellemző biomarkerek vizsgálata humán nyálmintákban

 

 

A szájüregi laphámkarcinóma Magyarországon a szájüregi daganatok közül az első helyen helyezkedik el. Mivel a korai diagnózis növeli a betegek túlélési esélyét így az új potenciális biomarkerek azonosításának kiemelkedő szerep juthat. Kutatócsoportunk célzott tömegspektrometriás és mikrogyöngy alapú fehérje kvantitálási módszerek segítségével olyan potenciális nyál biomarkerek vizsgálatát végzi, melyek elősegíthetik a betegség korai diagnózisát, ezáltal növelve a terápia sikerességét, a túlélést és javítva a betegek életminőségét.

 

 

Neurodegeneratív szemészeti kórképek biokémiai hátterének tanulmányozása

 

A glaucoma és a diabeteses retinopathia, olyan neurodegenratív szemészeti kórképek, melyek a retinális elváltozások következtében a visszafordíthatatlan vakság vezető okaiként tartanak számon világviszonylatban. A korszerű diagnózis felállításának elősegítéséhez kutatócsoportunk a fent említett betegektől gyűjtött könnyminták analízisét, továbbá különböző szemészetben alkalmazható képalkotó vizsgálatokat párosítva célozná meg a betegségek minél előbbi diagnózis felállításának elősegítését.

 

Fehérjék citrullinációs módosításának jelentősége különböző kórképekben

 

A fehérjék citrullinációja egy olyan poszttranszlációs módosítás, mely során a pozitív töltésű argininből semleges töltésű citrullin keletkezik a peptidil-arginin deimináz (PAD) enzim katalizálta reakcióban, így megváltoztatva a fehérje szerkezetét. Ennek a folyamatnak kiemelt jelentősége van fiziológiásan – a bőr keratinizációjától kezdve a génszabályozáson keresztül az immunfolyamatokig – és patológiás szempontból – ahol a citrullinált fehérjék új antigénként jelenhetnek meg és gyulladást indukálhatnak – egyaránt. Különböző gyulladással társult betegségek – mint például diabetses retinopathia, Alzheimer-kór, rheumatoid arthritis, kevert kötőszöveti betegség - különböző testfolyadékokból történő citrullinált fehérjék kimutatását célozzuk meg, immunológiai módszerek segítségével.

 

Szérum és könny vizsgálata cukorbetegségben és elhízásban

 

Az elhízás és a 2. típusú cukorbetegeség világszerte milliókat érintő betegségek. A betegség maga, vagy a betegséggel társult szövődmények megjelenése jelentős terheket ró a társadalomra. Ezen kutatás kapcsán célunk a könny és szérum proteómok digitalizálása és adatintenzív módszer használatával az elhízás – cukorbetegség átmenet tanulmányozása. Azonosítani kívánjuk az elhízás – korai 2. típusú cukorbetegeség – előrehaladott, komplikációkat mutató cukorbetegség tengelyre jellemző fehérjéket és útvonalakat és követni kívánjuk a szövődmények megjelenését a könny és a szérum fehérjék szintjén. Célunk a digitalizált könny és szérum proteómok tanulmányozása a lipid mediátorokkal és az immunválaszban szerepet játszó fehérjékkel, valamint a klinikai és szemészeti paraméterekkel együtt. Olyan könny és szérum fehérjéket szeretnénk azonosítani, amelyek potenciális biomarkerek lehetnek és segíthetnek az elhízás-cukorbetegség átmenet előrejelzésében, a komplikációk, mint pl. a diabéteszes retinopátia diagnózisában, vagy terápiás célpontként szolgálhatnak. A komplex adatintenzív vizsgálatokkal nyert eredményeinket sejtkultúrás vizsgálatokban kívánjuk ellenőrizni. Ugyanakkor a digitalizált könny és szérum proteómokat publikusan hozzáférhető adatbázisokba kívánjuk elhelyezni lehetőséget biztosítva a kutatók számára további elemzések elvégzésére. Ezáltal remélhetőleg felgyorsul a kutatási eredmények hasznosíthatósága és diagnosztikai vagy terápiás célú klinikai alkalmazása.

Publikációk

  1. Csosz, Eva; Toth, Ferenc; Mahdi, Mohamed; Tsaprailis, George; Emri, Miklos; Tozser, Jozsef (2019) Analysis of networks of host proteins in the early time points following HIV transduction. BMC BIOINFORMATICS  20, 398.
  2. Csősz, Éva ; Deák, Eszter ; Tóth, Noémi ; Traverso, Carlo Enrico ; Csutak, Adrienne (2019) Tőzsér, József: Comparative analysis of cytokine profiles of glaucomatous tears and aqueous humour reveals potential biomarkers for trabeculectomy complications. FEBS OPEN BIO 9: 5 pp. 1020-1028. , 9 p.
  3. Simon, Ádám ; Gulyás, Gabriella ; Mészár, Zoltán ; Bhide, Mangesh ; Oláh, János ; Bai, Péter ; Csősz, Éva ; Jávor, András ; Komlósi, István ; Remenyik, Judit et al. (2019) Proteomics alterations in chicken jejunum caused by 24 h fasting. PEERJ 7 p. e6588 , 19 p.
  4. Csősz, É ; Márkus, B ; Darula, Z ; Medzihradszky, K ; Nemes, J ; Tőzsér, J ; Kiss, C ; Márton, I (2018) Salivary proteome profiling of oral squamous cell carcinoma in a Hungarian population. FEBS OPEN BIO 8 pp. 556-569. , 14 p.
  5. Csősz, Éva ; Tóth, Noémi ; Deák, Eszter ; Csutak, Adrienne ; Tőzsér, József (2018) Wound-Healing Markers Revealed by Proximity Extension Assay in Tears of Patients following Glaucoma Surgery. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 19 : 12 Paper: 4096 , 19 p.
  6. Gulyas, Gabriella ; Pohoczky, Krisztina ; Csosz, Eva ; Simon, Adam ; Javor, Andras ; Czegledi, Levente (2018) Comparative proteome analysis of skeletal muscle between Merino and Tsigai lambs. SMALL RUMINANT RESEARCH 158 pp. 35-41. , 7 p.
  7. Virga, J ; Bognár, L ; Hortobágyi, T ; Zahuczky, G ; Csősz, É ; Kalló, G ; Tóth, J ; Hutóczki, G ; Reményi-Puskár, J ; Steiner, L et al. (2018) Tumor Grade versus Expression of Invasion-Related Molecules in Astrocytoma. PATHOLOGY AND ONCOLOGY RESEARCH 24 : 1 pp. 35-43. , 9 p.
  8. Virga, Jozsef ; Bognar, Laszlo ; Hortobagyi, Tibor ; Csosz, Eva ; Kallo, Gergo ; Zahuczki, Gabor ; Steiner, Laszlo ; Hutoczki, Gabor ; Remenyi-Puskar, Judit ; Klekner, Almos (2018) The Expressional Pattern of Invasion-Related Extracellular Matrix Molecules in CNS Tumors. CANCER INVESTIGATION 36 : 9-10 pp. 492-503. , 12 p.
  9. Márkus B, Szabó K, Pfliegler WP, Petrényi K, Boros E, Pócsi I, Tőzsér J, Csősz É, Dombrádi V (2017) Proteomic analysis of protein phosphatase Z1 from Candida albicans. PLoS One. 12:e0183176.
  10. Márkus B, Pató Z, Sarang Z, Albert R, Tőzsér J, Petrovski G, Csősz É. (2017) The proteomic profile of a mouse model of proliferative vitreoretinopathy. FEBS Open Bio. 7:1166-1177.
  11. Kecskemeti A, Nagy C, Csosz E, Kallo G, Gaspar A. (2017) The application of a microfluidic reactor including spontaneously adsorbed trypsin for rapid protein digestion of human tear samples. Proteomics Clin Appl. 2017 Jul 8. [Epub ahead of print.
  12. Csősz É, Lábiscsák P, Kalló G, Márkus B, Emri M, Szabó A, Tar I, Tőzsér J, Kiss C, Márton I. (2017) Proteomics investigation of OSCC-specific salivary biomarkers in a Hungarian population highlights the importance of identification of population-tailored biomarkers. PLoS One. 12:e0177282.
  13. Kecskemeti A, Bako J, Csarnovics I, Csosz E, Gaspar A. (2017) Development of an enzymatic reactor applying spontaneously adsorbed trypsin on the surface of a PDMS microfluidic device. Anal Bioanal Chem. 409:3573-3585.
  14. Virga J, Bognár L, Hortobágyi T, Zahuczky G, Csősz É, Kalló G, Tóth J, Hutóczki G, Reményi-Puskár J, Steiner L, Klekner A. (2017) Tumor Grade versus Expression of Invasion-Related Molecules in Astrocytoma. Pathol Oncol Res. 2017 Feb 4. [Epub ahead of print]
  15. Tarapcsák S, Szalóki G, Telbisz Á, Gyöngy Z, Matúz K, Csősz É, Nagy P, Holb IJ, Rühl R, Nagy L, Szabó G, Goda K. (2017) Interactions of retinoids with the ABC transporters P-glycoprotein and Breast Cancer Resistance Protein. Sci Rep. 7:41376.
  16. Csősz É, Kalló G, Jakob B, Deák E, Csutak A, Tőzsér J. (2017) Quantitative body fluid proteomics in medicine - A focus on minimal invasiveness. J Proteomics. 153:30-43.
  17. Virga J, Bognár L, Hortobágyi T, Zahuczky G, Csősz É, Kalló G, Tóth J, Hutóczki G, Reményi-Puskár J, Steiner L, Klekner A. (2017) Prognostic Role of the Expression of Invasion-Related Molecules in Glioblastoma. J Neurol Surg A Cent Eur Neurosurg. 78:12-19.
  18. Csomós K, Kristóf E, Jakob B, Csomós I, Kovács G, Rotem O, Hodrea J, Bagoly Z, Muszbek L, Balajthy Z, Csősz É, Fésüs L. (2017) Protein cross-linking by chlorinated polyamines and transglutamylation stabilizes neutrophil extracellular traps. Cell Death Dis. 7:e2332.
  19. Csősz É, Deák E, Kalló G, Csutak A, Tőzsér J. (2017) Diabetic retinopathy: Proteomic approaches to help the differential diagnosis and to understand the underlying molecular mechanisms. J Proteomics. 150:351-358.
  20. G. Gulyas, E. Csosz, J. Prokisch, A. Javor, M. Mezes, M. Erdely3, K. Balogh, T. Janaky, Z. Szabo, A. Simon, L. Czegledi (2017) Effect of nano-sized, elemental selenium supplement on the proteome of chicken liver, Journal of Animal Physiology and Nutrition, 101:502-510.
  21. Gergő Kalló, Miklós Emri, Zsófia Varga, Bernadett Ujhelyi, József Tőzsér, Adrienne Csutak and Éva Csősz (2016) Changes in the chemical barrier composition of tears in Alzheimer's disease reveal potential tear diagnostic biomarkers. PLoS One. 11(6):e0158000.
  22. Gábor Hutóczki, László Bognár, Judit Tóth, Beáta Scholtz, Gábor Zahuczky, Zoltán Hanzély, Éva Csősz, Judit Reményi-Puskár, Gergő Kalló, Tibor Hortobágyi, Almos Klekner (2016) Effect of concomitant radiochemotherapy on invasion potential of glioblastoma, Pathol Oncol Res. 22:155-60.
  23. Álmos Klekner, Gábor Hutóczki, József Virga, Judit Reményi-Puskár, Judit Tóth, Beáta Scholtz, Éva Csősz, Gergő Kalló, László Steiner, Tibor Hortobágyi, László Bognár (2015) Expression pattern of invasion-related molecules in the peritumoral brain, Clin Neurol Neurosurg. 139:138-43.
  24. Gerardo Alvarado, Viktória Jeney, Attila Tóth, Éva Csősz, Gergő Kalló, Thanh An Huynh, Csaba Hajnal, Judit Kalász, Enikő T. Pásztor, István Édes, Magnus Gram, Bo Akerström, Ann Smith, John W. Eaton, György Balla, Zoltán Papp, József Balla (2015) Heme-induced contractile dysfunction in human cardiomyocytes caused by oxidant damage to thick filament proteins, Free Radical Biology and Medicine 89:248-62.
  25. Gergő Kalló, Arunima Chatterjee, Márta Tóth, Éva Rajnavölgyi, Adrienne Csutak, József Tőzsér, Éva Csősz (2015) Relative quantification of human β-defensins by an SRM-based proteomics approach, Rapid Communications in Mass Spectrometry, 29:1623–1631.
  26. Eva Csosz, Gabriella Emri, Gergő Kalló, George Tsaprailis, József Tőzsér (2015) Highly abundant defense proteins in human sweat as revealed by targeted proteomics and label free quantification mass spectrometry. Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology, 29(10):2024-2031.
  27. Zsolt Torok, Tunde Peto, Eva Csosz, Edit Tukacs, Agnes M Molnar, Andras Berta, Jozsef Tozser, Andras Hajdu, Valeria Nagy, Balint Domokos, Adrienne Csutak (2014) Combined Methods for Diabetic Retinopathy Screening, Using Retina Photographs and Tear Fluid Proteomics Biomarkers. Journal of Diabetes Research. 501.
  28. Csutak A., Török Z., Csősz É., Pető T. (2014) Látásmentő új szűrés. Term. Vil. 145, 207-210.
  29. Torok Z, Peto T, Csosz E, Tukacs E, Molnar A, Maros-Szabo Z, Berta A, Tozser J, Hajdu A, Nagy V, Domokos B, Csutak A. (2013) Tear fluid proteomics multimarkers for diabetic retinopathy screening. BMC Ophthalmol. 13:40.
  30. Palicz Z, Jenes A, Gáll T, Miszti-Blasius K, Kollár S, Kovács I, Emri M, Márián T, Leiter E, Pócsi I, Csősz E, Kalló G, Hegedűs C, Virág L, Csernoch L, Szentesi P. (2013) In vivo application of a small molecular weight antifungal protein of Penicillium chrysogenum (PAF). Toxicol Appl Pharmacol. 269:8-16.
  31. Csősz E, Boross P, Csutak A, Berta A, Tóth F, Póliska S, Török Z, Tőzsér J. (2012) Quantitative analysis of proteins in the tear fluid of patients with diabetic retinopathy. J Proteomics. 75:2196-2204.

Médiavisszhang

Omikai Fórum

Címke: 
Kutatcsoport